日本本科留学申请的途径主要有以下几种：

直接申请日本大学本科：这种方式适用于高考成绩优异、日语水平较高的学生。申请者需要达到日语N2级或以上水平，并通过日本留学生考试(EJU)，以及可能需要的日本大学组织的面试。这种方式的优势在于可以省去语言学校的学习时间和费用，直接进入大学学习。

先就读语言学校再申请大学本科：对于日语水平不够或希望在日本适应一段时间再申请大学的学生来说，这是一个较为稳妥的方案。在语言学校学习期间，学生可以提高日语水平，参加日本留学生考试(EJU)，并根据自己的成绩和兴趣选择合适的大学和专业。同时，语言学校还会为学生提供升学指导服务，帮助学生顺利申请到心仪的大学。

在国内准备并参加日本留学生考试(EJU)：如今，越来越多的学生注意到留学前准备的重要性，选择在国内就进行EJU的准备。这种方式建议日语非常好，而且专业能力也非常强的同学去尝试。学生可以申请考试时间的旅游签证，去参加留学考试和意向学校的校内考试。

申请日本SGU英文授课学部项目：这是全英文授课的项目，申请去日本留学的时候不需要日语成绩，也不用参加EJU考试，但是一般要求学生提供SAT、托福、雅思等考试的成绩。这个项目适合英语水平较高的学生。

以上是日本本科留学申请的主要途径，每种方式都有其特点和要求，申请者可以根据自己的实际情况和兴趣进行选择。同时，申请者还需要注意了解日本大学的招生要求和申请流程，做好充分的准备和规划。